شورای سازمان :

اعضاي شورا :

ماده 5 -اعضای شورای سازمان عبارتند از:

1 - وزیر آموزش و پرورش که ریاست شورا را بر عهده دارد.

2 - وزیر یا یکی از معاونان وزارت کار و امور اجتماعی.

3 - رئیس سازمان بهزیستی کشور.

4 - رئیس یا یکی از معاونان بنیاد مستضعفان و جانبازان انقلاب اسلامی.

5 - معاونان وزارت آموزش و پرورش در امور آموزشی، پژوهشی، فنی و حرفه‌ای و پرورشی و تأمین تربیت نیروی انسانی.

6 - رئیس سازمان که سمت دبیری شورا را عهده‌دار است.

7 - دو نفر از متخصصان امور کودکان استثنایی.

8 - یک نفر از معلمان صاحبنظر و باتجربه در امور کودکان استثنایی.

9 - دو نفر از معتمدین علاقمند به امور کودکان استثنایی. "‌اولویت با والدینی است که فرزندان استثنایی دارند".

10 - یک نفر از معلولین صاحب‌نظر در امور کودکان استثنایی با معرفی سازمان بهزیستی کشور با اولویت خواهران.

11 - یک نفر از اعضاء کمیسیون آموزش و پرورش به انتخاب کمیسیون آموزش و پرورش.
‌تبصره 1 -اعضای مذکور در بندهای (7) و (8) و (9) برای مدت چهار سال توسط وزیر
آموزش و پرورش انتخاب و با حکم وی منصوب‌می‌شوند. یک نفر از متخصصان موضوع بند (7) به پیشنهاد وزیر فرهنگ و آموزش عالی و اعضاء مذکور در بند (9) به پیشنهاد رئیس سازمان بهزیستی‌خواهد بود.

تبصره 2 -نحوه تشکیل و اداره جلسات شورا بر اساس آیین‌نامه‌ای خواهد بود که به تصویب شورا می‌رسد.

وظايف شورا :

ماده 6 -شورای سازمان دارای وظایف زیر می‌باشد:

1 - تعیین خط مشی‌های کلی سازمان و نظارت بر تحقق اهداف سازمان.

2 - تصویب مقررات خاص استخدامی سازمان که توسط رئیس سازمان و با هماهنگی سازمان امور اداری و استخدامی کشور تهیه می‌گردد.

3 - تصویب ضوابط مربوط به اجرای تبصره (5) ماده واحده قانون تشکیل سازمان که توسط رئیس سازمان پیشنهاد می‌گردد.

4 - تصویب برنامه و بودجه سالانه سازمان.

5 - تصویب ضوابط و دستورالعملهای اجرایی سازمان که توسط رئیس و اعضاء سازمان پیشنهاد می‌گردد.